MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Borrelia burgdorferi B31 plasmid cp32-1

Total Repeats: 805

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000948	TAA	2	6	46	51	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_000948	GT	3	6	66	71	0 %	50 %	50 %	0 %	11497090
3	NC_000948	AAAAC	2	10	81	90	80 %	0 %	0 %	20 %	11497090
4	NC_000948	T	6	6	135	140	0 %	100 %	0 %	0 %	11497090
5	NC_000948	AGA	2	6	164	169	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497090
6	NC_000948	TGC	2	6	200	205	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497090
7	NC_000948	TAT	2	6	272	277	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497090
8	NC_000948	AAC	2	6	343	348	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497090
9	NC_000948	CAA	2	6	449	454	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497090
10	NC_000948	AT	3	6	504	509	50 %	50 %	0 %	0 %	11497090
11	NC_000948	ATTT	3	12	573	584	25 %	75 %	0 %	0 %	11497090
12	NC_000948	TAGAAA	2	12	598	609	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	11497090
13	NC_000948	CT	3	6	675	680	0 %	50 %	0 %	50 %	11497090
14	NC_000948	CAA	2	6	685	690	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497090
15	NC_000948	CTT	2	6	691	696	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497090
16	NC_000948	AAT	2	6	717	722	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497090
17	NC_000948	TCT	2	6	744	749	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497090
18	NC_000948	T	6	6	749	754	0 %	100 %	0 %	0 %	11497090
19	NC_000948	AAT	2	6	855	860	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497090
20	NC_000948	TTA	2	6	904	909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497090
21	NC_000948	AGG	2	6	931	936	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497090
22	NC_000948	ATTA	2	8	944	951	50 %	50 %	0 %	0 %	11497090
23	NC_000948	ATG	2	6	1024	1029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497090
24	NC_000948	ATT	2	6	1048	1053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497090
25	NC_000948	GAA	2	6	1161	1166	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497090
26	NC_000948	TAA	2	6	1241	1246	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497090
27	NC_000948	GAG	2	6	1248	1253	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497090
28	NC_000948	ATT	2	6	1274	1279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497090
29	NC_000948	AGA	2	6	1317	1322	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497091
30	NC_000948	AGA	2	6	1326	1331	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497091
31	NC_000948	AGA	2	6	1350	1355	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497091
32	NC_000948	GCA	2	6	1356	1361	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497091
33	NC_000948	GTTC	2	8	1677	1684	0 %	50 %	25 %	25 %	11497091
34	NC_000948	GA	3	6	1739	1744	50 %	0 %	50 %	0 %	11497091
35	NC_000948	ATTAA	2	10	1780	1789	60 %	40 %	0 %	0 %	11497091
36	NC_000948	A	6	6	1791	1796	100 %	0 %	0 %	0 %	11497091
37	NC_000948	TTC	3	9	1809	1817	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497091
38	NC_000948	AGA	2	6	1854	1859	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497091
39	NC_000948	ATAC	2	8	1928	1935	50 %	25 %	0 %	25 %	11497091
40	NC_000948	CAA	2	6	2086	2091	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497092
41	NC_000948	T	6	6	2141	2146	0 %	100 %	0 %	0 %	11497092
42	NC_000948	TGG	2	6	2154	2159	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497092
43	NC_000948	AAC	2	6	2250	2255	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497092
44	NC_000948	TGG	3	9	2274	2282	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497092
45	NC_000948	GT	3	6	2299	2304	0 %	50 %	50 %	0 %	11497092
46	NC_000948	AAAG	2	8	2379	2386	75 %	0 %	25 %	0 %	11497092
47	NC_000948	TAAAT	2	10	2415	2424	60 %	40 %	0 %	0 %	11497092
48	NC_000948	CA	3	6	2498	2503	50 %	0 %	0 %	50 %	11497092
49	NC_000948	ATTT	2	8	2516	2523	25 %	75 %	0 %	0 %	11497092
50	NC_000948	TGCT	2	8	2528	2535	0 %	50 %	25 %	25 %	11497092
51	NC_000948	TAA	2	6	2566	2571	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497092
52	NC_000948	GCT	2	6	2656	2661	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497093
53	NC_000948	GCAA	2	8	2676	2683	50 %	0 %	25 %	25 %	11497093
54	NC_000948	TGA	2	6	2739	2744	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497093
55	NC_000948	A	6	6	2761	2766	100 %	0 %	0 %	0 %	11497093
56	NC_000948	TA	3	6	2964	2969	50 %	50 %	0 %	0 %	11497093
57	NC_000948	CTGATA	2	12	2984	2995	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	11497093
58	NC_000948	ATGT	2	8	3014	3021	25 %	50 %	25 %	0 %	11497093
59	NC_000948	ATAA	2	8	3121	3128	75 %	25 %	0 %	0 %	11497093
60	NC_000948	TTA	2	6	3137	3142	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497093
61	NC_000948	CCA	2	6	3160	3165	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	11497093
62	NC_000948	AT	3	6	3178	3183	50 %	50 %	0 %	0 %	11497093
63	NC_000948	CAAT	2	8	3203	3210	50 %	25 %	0 %	25 %	11497093
64	NC_000948	TGG	2	6	3330	3335	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497093
65	NC_000948	AGG	2	6	3356	3361	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_000948	TAAA	2	8	3362	3369	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_000948	AAG	2	6	3410	3415	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_000948	T	6	6	3501	3506	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_000948	ATC	2	6	3550	3555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
70	NC_000948	TGG	2	6	3647	3652	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000948	CTA	2	6	3706	3711	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_000948	AAT	2	6	3726	3731	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000948	TAA	2	6	3791	3796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000948	TTTA	2	8	3889	3896	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_000948	TAA	2	6	3939	3944	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_000948	GGA	2	6	3951	3956	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_000948	ATT	2	6	3968	3973	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556427
78	NC_000948	TGA	2	6	3974	3979	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556427
79	NC_000948	ATT	2	6	3982	3987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556427
80	NC_000948	TAT	2	6	4031	4036	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556427
81	NC_000948	A	6	6	4093	4098	100 %	0 %	0 %	0 %	364556427
82	NC_000948	ACA	2	6	4134	4139	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	364556427
83	NC_000948	ATT	2	6	4201	4206	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556427
84	NC_000948	AT	3	6	4271	4276	50 %	50 %	0 %	0 %	364556427
85	NC_000948	TAA	3	9	4286	4294	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556427
86	NC_000948	AGT	2	6	4329	4334	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556427
87	NC_000948	ATT	2	6	4338	4343	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556427
88	NC_000948	TTA	2	6	4348	4353	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556427
89	NC_000948	GCT	2	6	4433	4438	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	364556427
90	NC_000948	AGA	2	6	4460	4465	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556427
91	NC_000948	GTG	2	6	4474	4479	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	364556427
92	NC_000948	CGA	2	6	4544	4549	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556427
93	NC_000948	GAT	2	6	4562	4567	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556427
94	NC_000948	GCA	3	9	4614	4622	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556427
95	NC_000948	GCA	2	6	4629	4634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	364556427
96	NC_000948	AGT	2	6	4635	4640	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556427
97	NC_000948	TAA	2	6	4685	4690	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	364556427
98	NC_000948	AGA	2	6	4694	4699	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556427
99	NC_000948	TTA	2	6	4765	4770	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556427
100	NC_000948	CTAC	2	8	4794	4801	25 %	25 %	0 %	50 %	364556427
101	NC_000948	TCAT	2	8	4841	4848	25 %	50 %	0 %	25 %	364556427
102	NC_000948	CTA	2	6	4879	4884	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556427
103	NC_000948	GAA	3	9	4981	4989	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556428
104	NC_000948	TACT	2	8	5150	5157	25 %	50 %	0 %	25 %	364556428
105	NC_000948	GTT	2	6	5194	5199	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556428
106	NC_000948	GAATTT	2	12	5203	5214	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	364556428
107	NC_000948	A	6	6	5224	5229	100 %	0 %	0 %	0 %	364556428
108	NC_000948	TGAACT	2	12	5241	5252	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	364556428
109	NC_000948	ATT	2	6	5255	5260	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556428
110	NC_000948	TAG	2	6	5265	5270	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	364556428
111	NC_000948	GAA	2	6	5281	5286	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	364556428
112	NC_000948	GGC	2	6	5287	5292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	364556428
113	NC_000948	TG	3	6	5380	5385	0 %	50 %	50 %	0 %	364556428
114	NC_000948	AATG	2	8	5396	5403	50 %	25 %	25 %	0 %	364556428
115	NC_000948	TGT	2	6	5489	5494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	364556429
116	NC_000948	TTC	2	6	5510	5515	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	364556429
117	NC_000948	AG	3	6	5521	5526	50 %	0 %	50 %	0 %	364556429
118	NC_000948	TTA	2	6	5563	5568	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	364556429
119	NC_000948	TGG	2	6	5812	5817	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497067
120	NC_000948	TAG	2	6	5893	5898	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497067
121	NC_000948	AT	3	6	5914	5919	50 %	50 %	0 %	0 %	11497067
122	NC_000948	AAT	2	6	5921	5926	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497067
123	NC_000948	TA	3	6	5930	5935	50 %	50 %	0 %	0 %	11497067
124	NC_000948	CTA	2	6	6014	6019	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497067
125	NC_000948	AAGT	2	8	6061	6068	50 %	25 %	25 %	0 %	11497067
126	NC_000948	GTA	2	6	6078	6083	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497067
127	NC_000948	GCA	2	6	6089	6094	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497067
128	NC_000948	TTG	2	6	6102	6107	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497067
129	NC_000948	AAT	2	6	6229	6234	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497068
130	NC_000948	ATC	2	6	6263	6268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497068
131	NC_000948	GCT	2	6	6289	6294	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497068
132	NC_000948	ATA	2	6	6304	6309	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497068
133	NC_000948	AT	4	8	6406	6413	50 %	50 %	0 %	0 %	11497068
134	NC_000948	TAA	2	6	6546	6551	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497068
135	NC_000948	AGG	2	6	6686	6691	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	11497068
136	NC_000948	TAG	2	6	6751	6756	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497095
137	NC_000948	ATT	2	6	6762	6767	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497095
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139	NC_000948	TGC	2	6	6817	6822	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497095
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276	NC_000948	CAT	2	6	12220	12225	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497102
277	NC_000948	TA	3	6	12229	12234	50 %	50 %	0 %	0 %	11497102
278	NC_000948	AATCT	2	10	12262	12271	40 %	40 %	0 %	20 %	11497102
279	NC_000948	AAT	2	6	12295	12300	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497102
280	NC_000948	CAAAC	2	10	12314	12323	60 %	0 %	0 %	40 %	11497102
281	NC_000948	A	8	8	12333	12340	100 %	0 %	0 %	0 %	11497102
282	NC_000948	ATA	2	6	12347	12352	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497102
283	NC_000948	AATT	2	8	12432	12439	50 %	50 %	0 %	0 %	11497102
284	NC_000948	GTTT	2	8	12452	12459	0 %	75 %	25 %	0 %	11497102
285	NC_000948	AAT	2	6	12513	12518	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497069
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287	NC_000948	TTG	2	6	12550	12555	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	11497069
288	NC_000948	TGA	2	6	12563	12568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497069
289	NC_000948	CTC	2	6	12625	12630	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11497069
290	NC_000948	GGACT	2	10	12636	12645	20 %	20 %	40 %	20 %	11497069
291	NC_000948	A	6	6	12692	12697	100 %	0 %	0 %	0 %	11497069
292	NC_000948	TAA	2	6	12736	12741	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497069
293	NC_000948	ACT	2	6	12750	12755	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497069
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296	NC_000948	T	8	8	12783	12790	0 %	100 %	0 %	0 %	11497069
297	NC_000948	GAC	2	6	12929	12934	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	11497070
298	NC_000948	ATT	2	6	12956	12961	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497070
299	NC_000948	TCT	2	6	12965	12970	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497070
300	NC_000948	GAA	3	9	12983	12991	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497070
301	NC_000948	TAAT	2	8	12993	13000	50 %	50 %	0 %	0 %	11497070
302	NC_000948	T	7	7	13013	13019	0 %	100 %	0 %	0 %	11497070
303	NC_000948	TGG	2	6	13033	13038	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	11497070
304	NC_000948	GCT	2	6	13049	13054	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497070
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306	NC_000948	TCT	2	6	13070	13075	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497070
307	NC_000948	AT	3	6	13169	13174	50 %	50 %	0 %	0 %	11497070
308	NC_000948	AAC	2	6	13264	13269	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497070
309	NC_000948	TACTT	2	10	13279	13288	20 %	60 %	0 %	20 %	11497070
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323	NC_000948	TAC	2	6	14086	14091	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	11497071
324	NC_000948	ATTT	2	8	14092	14099	25 %	75 %	0 %	0 %	11497071
325	NC_000948	A	6	6	14128	14133	100 %	0 %	0 %	0 %	11497071
326	NC_000948	AAG	2	6	14150	14155	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497071
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330	NC_000948	TAA	2	6	14272	14277	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497071
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339	NC_000948	ATTA	2	8	14611	14618	50 %	50 %	0 %	0 %	11497072
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350	NC_000948	ATA	2	6	14958	14963	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497072
351	NC_000948	A	6	6	14972	14977	100 %	0 %	0 %	0 %	11497072
352	NC_000948	TGA	2	6	14998	15003	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497072
353	NC_000948	TACA	2	8	15007	15014	50 %	25 %	0 %	25 %	11497072
354	NC_000948	A	6	6	15087	15092	100 %	0 %	0 %	0 %	11497072
355	NC_000948	CCT	2	6	15096	15101	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11497072
356	NC_000948	TA	3	6	15167	15172	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
357	NC_000948	TAAAAA	2	12	15182	15193	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
358	NC_000948	A	6	6	15210	15215	100 %	0 %	0 %	0 %	11497073
359	NC_000948	ATTAA	2	10	15224	15233	60 %	40 %	0 %	0 %	11497073
360	NC_000948	CTT	2	6	15239	15244	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497073
361	NC_000948	TTC	2	6	15315	15320	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497073
362	NC_000948	AATGGT	2	12	15374	15385	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497073
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365	NC_000948	TGA	2	6	15508	15513	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	11497074
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368	NC_000948	TCAA	2	8	15651	15658	50 %	25 %	0 %	25 %	11497074
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377	NC_000948	AT	3	6	15890	15895	50 %	50 %	0 %	0 %	11497075
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379	NC_000948	ATA	2	6	15978	15983	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	11497075
380	NC_000948	A	7	7	16008	16014	100 %	0 %	0 %	0 %	11497075
381	NC_000948	TCACT	2	10	16018	16027	20 %	40 %	0 %	40 %	11497075
382	NC_000948	CAA	2	6	16040	16045	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	11497075
383	NC_000948	TTGTT	2	10	16115	16124	0 %	80 %	20 %	0 %	364556430
384	NC_000948	CAC	2	6	16134	16139	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	364556430
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387	NC_000948	AT	3	6	16363	16368	50 %	50 %	0 %	0 %	364556430
388	NC_000948	A	6	6	16381	16386	100 %	0 %	0 %	0 %	364556430
389	NC_000948	ATC	2	6	16412	16417	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	364556430
390	NC_000948	CAA	2	6	16497	16502	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
391	NC_000948	TAAT	2	8	16575	16582	50 %	50 %	0 %	0 %	11497077
392	NC_000948	TTA	2	6	16604	16609	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497077
393	NC_000948	AAG	2	6	16674	16679	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497077
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395	NC_000948	GCT	2	6	16786	16791	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497077
396	NC_000948	ATTT	2	8	16890	16897	25 %	75 %	0 %	0 %	11497077
397	NC_000948	AGA	2	6	16926	16931	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	11497077
398	NC_000948	TCC	2	6	16954	16959	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	11497077
399	NC_000948	TTTC	2	8	16973	16980	0 %	75 %	0 %	25 %	11497077
400	NC_000948	TCT	2	6	16984	16989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	11497077
401	NC_000948	TGC	2	6	17022	17027	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	11497077
402	NC_000948	A	6	6	17028	17033	100 %	0 %	0 %	0 %	11497077
403	NC_000948	AAT	3	9	17078	17086	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
404	NC_000948	TC	3	6	17123	17128	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
405	NC_000948	ATTTT	2	10	17181	17190	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
406	NC_000948	AAGGA	2	10	17215	17224	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
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408	NC_000948	ATT	2	6	17249	17254	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	11497078
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